알려주세요..

どなたか是非教えてください。
よろしくお願いします。

去年の6月に前の会社を辞めて7月から今の会社に転職しました。
その後、就労資格証明交付申請は10月に入ってから出しました。
やっと今年の1月に入国管理局から手紙が届きましたが、内容は就労資格証明書交付申請不交付処分の知らせでした。
もっと厳密に言いますと、在留資格の「人文知識・国際業務」に該当しないとのことでした。
今の会社は介護関係の仕事で、2年ほど前から中国に合弁会社及び老人ホームを立ち上げしているところです。
ただし、まだ設立中とのこともあり、ホームページ上にも中国に係わる業務は公開していません。
したがって、中国の事業をやっているかどうかは知られていないのが事実です。
一応会社側で、入管に問い合わせして（私も同席）、今はもう一度書類を揃えてるところですが・・・
一度こんな履歴が残りますと、2回目申請しても許可は難しいでしょうか？
また、出なかったら私はどうすればいいでしょうか？
自分で悩んでも、答えが出ないし会社にこのまま任せるだけでいいか分からなくて・・・

それでは、良い返答をお待ちします。